Las lycoris son niñas huérfanas entrenadas como asesinas profesionales para mantener la paz en Japón mientras se hacen pasar por colegialas. Chisato y Takina son dos de ellas que acaban formando equipo inesperadamente, y aunque sus personalidades son opuestas, poco a poco se van conociendo mejor y creando una buena química entre ellas. Tendrán que hacer frente a criminales, amenazas terroristas y conspiraciones, pero entre misión y misión, también se harán cargo de la cafetería LycoReco, donde no faltarán inolvidables aventuras, ¡como los inventos culinarios de Takina! Todo eso mientras somos testigos del día a día de algunos de los personajes secundarios de la historia. ¡Las protagonistas no estarán solas!